Устанавливать веб-агент через командную строку рекомендуется:

•в небольших и средних организациях, где компьютеры пользователей объединены в рабочую группу;

•в организациях с доменной структурой сети, если необходимо установить компонент на компьютер конкретного пользователя.

Для установки используйте командную строку:

msiexec /I <MSI-пакет> /qn

Пример:

msiexec /I WebAccessAgent.Ru.msi /qn

Описание ключей Msiexec см. в документации Microsoft.